兩位特殊部隊的隊員坐在運輸機內，盯著監控的屏幕。突然一聲警報響起，系統檢測到有怪獸出現。這時候特殊部隊隊員比留間弦人下達了新的指令，弦人命令所有人按照預案去指定地點集合。一頭來自宇宙的怪獸甲殼怪獸從天而降，巨大的沖擊力給城市帶來了很大的破壞。地面防衛部隊與怪獸展開了激烈交戰。怪獸的肆意破壞摧毀了很多大樓，怪獸出現的地方化為了一片火海。弦人為了拯救還沒有逃出的群眾，獨自沖入火海救人。弦人在救人過程中出現意外，關鍵時刻他體內涌現出一道神秘的光。新的奧特曼就此誕生了，新的奧特曼不光救下了弦人隊長，還打敗了怪獸。地球防衛隊日本支部的參謀長宣布成立全新的小隊，全稱叫特殊怪獸對應分遣隊。招攬優秀的戰斗人員組成一支精英小隊專門處理怪獸。